Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms