Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AC091078.1-202ENST00000543286 2012 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 APOL3-205ENST00000397293 2214 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 CADM3-202ENST00000368125 3745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 LGALS8-208ENST00000416919 6097 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 C14orf119-201ENST00000319074 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 CNTNAP2-201ENST00000361727 9896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 DAAM2-208ENST00000538976 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 TCF4-202ENST00000356073 8317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 PCDHGA7-201ENST00000518325 4605 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 FYCO1-201ENST00000296137 8504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 BCL2L11-223ENST00000622612 4995 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 SLC45A4-203ENST00000519067 7483 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms