Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms