Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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