Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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RNF7Q9UBF6 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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RNF7Q9UBF6 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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RNF7Q9UBF6 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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RNF7Q9UBF6 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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RNF7Q9UBF6 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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RNF7Q9UBF6 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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RNF7Q9UBF6 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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RNF7Q9UBF6 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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