Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms