Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms