Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms