Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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C9orf16Q9BUW7 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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C9orf16Q9BUW7 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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