Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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