Protein–RNA interactions for Protein: Q86V35

CABP7, Calcium-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP7Q86V35 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms