Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TCF23Q7RTU1 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms