Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
CSPP1Q1MSJ5 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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