Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms