Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX3P78415 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX3P78415 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX3P78415 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX3P78415 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX3P78415 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX3P78415 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX3P78415 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX3P78415 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX3P78415 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX3P78415 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX3P78415 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX3P78415 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX3P78415 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX3P78415 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX3P78415 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX3P78415 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX3P78415 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX3P78415 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX3P78415 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRX3P78415 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRX3P78415 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRX3P78415 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRX3P78415 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRX3P78415 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRX3P78415 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRX3P78415 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms