Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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