Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP7P55210 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP7P55210 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP7P55210 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP7P55210 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP7P55210 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP7P55210 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP7P55210 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP7P55210 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP7P55210 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP7P55210 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP7P55210 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP7P55210 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms