Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK8P49336 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK8P49336 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK8P49336 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms