Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms