Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FDFT1P37268 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms