Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC8A1P32418 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms