Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms