Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XBP1P17861 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms