Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC175P0C221 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms