Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CREB3O43889 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CREB3O43889 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CREB3O43889 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CREB3O43889 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CREB3O43889 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CREB3O43889 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CREB3O43889 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CREB3O43889 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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