Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms