Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms