Protein–RNA interactions for Protein: B9A030

TISP43, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TISP43B9A030 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TISP43B9A030 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms