Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms