Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PACSIN2Q9UNF0 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms