Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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SPOCK3Q9BQ16 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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SPOCK3Q9BQ16 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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SPOCK3Q9BQ16 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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SPOCK3Q9BQ16 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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SPOCK3Q9BQ16 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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SPOCK3Q9BQ16 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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SPOCK3Q9BQ16 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 BPNT1-201ENST00000322067 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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