Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
UBE2E2Q96LR5 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms