Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms