Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms