Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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RTL8BQ17RB0 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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RTL8BQ17RB0 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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RTL8BQ17RB0 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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RTL8BQ17RB0 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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RTL8BQ17RB0 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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