Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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