Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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CUL3Q13618 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
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CUL3Q13618 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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