Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CD83Q01151 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
CD83Q01151 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CD83Q01151 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD83Q01151 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD83Q01151 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms