Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms