Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 WASF3-201ENST00000335327 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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