Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms