Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MLH1P40692 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MLH1P40692 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MLH1P40692 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MLH1P40692 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MLH1P40692 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MLH1P40692 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MLH1P40692 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MLH1P40692 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MLH1P40692 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MLH1P40692 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MLH1P40692 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MLH1P40692 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MLH1P40692 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MLH1P40692 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MLH1P40692 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MLH1P40692 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MLH1P40692 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MLH1P40692 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MLH1P40692 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MLH1P40692 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MLH1P40692 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms