Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPB2P35606 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms