Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP1P29466 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP1P29466 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms