Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTSSP25774 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTSSP25774 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTSSP25774 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTSSP25774 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTSSP25774 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTSSP25774 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTSSP25774 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTSSP25774 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTSSP25774 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTSSP25774 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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CTSSP25774 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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CTSSP25774 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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CTSSP25774 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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CTSSP25774 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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CTSSP25774 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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CTSSP25774 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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CTSSP25774 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTSSP25774 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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CTSSP25774 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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CTSSP25774 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTSSP25774 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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