Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms