Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC130P13994 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC130P13994 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC130P13994 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC130P13994 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC130P13994 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC130P13994 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC130P13994 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC130P13994 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC130P13994 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC130P13994 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC130P13994 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC130P13994 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC130P13994 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC130P13994 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC130P13994 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC130P13994 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC130P13994 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC130P13994 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC130P13994 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC130P13994 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC130P13994 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC130P13994 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC130P13994 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC130P13994 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC130P13994 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC130P13994 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC130P13994 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC130P13994 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC130P13994 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC130P13994 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC130P13994 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC130P13994 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC130P13994 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC130P13994 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC130P13994 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC130P13994 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC130P13994 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC130P13994 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms