Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTAP09496 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLTAP09496 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLTAP09496 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLTAP09496 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLTAP09496 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLTAP09496 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTAP09496 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms