Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms