Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms